سـازمان مـديريت و برنـامهريزي كشـور، به عـنوان دبـيرخانه شـورا مسئوليت هدايت و جمعبندي تمامي امور مطالعاتي و تهيه طرحهاي توسعه مناطق كويري با استفاده از مشاوران ذيصلاح و كميسيونهاي تخصصي با هماهنگي شورا را به عهده دارد.